Tiene su sede en un área del antiguo Convento Grande de San Francisco de Querétaro, que es una de las construcciones Virreinales más significativas de México.
El inmueble histórico data del siglo XVIII, las salas contienen colecciones diversas a través de las cuáles se cuenta la historia de Querétaro y México.
Exposición permanente de la historia regional, documentos e imágenes de los hechos más relevantes de la historia de Querétaro.